主角有马拓也为一个无所事()事的高中生,他父亲是历史学家,却在研究时失踪,留下他与继母两人相依为()命。暑假时主角收到父亲寄来的包裹,里面有一个罗盘和三颗水晶珠,以及()一封写着「时间是可逆的,历史是不可逆的」云()云以及一()些关于平行世界概念的信,并交待主角晚上去当()地()有名的()地标()剑之岬去见一个人。
拓也晚上如约来到剑之岬,发现自己的继母亚由美和父亲研究夥伴龙藏寺幸三都在场。原本和蔼的龙藏寺突然翻脸要有马把收()到的()邮包()交出来,并拔出枪来威胁他,千钧一发之际,一道闪电落下劈在了神社的御神石()上,拓也就此晕去。等拓也甦醒过来周围已经旁无一人,回家睡了一觉后才发现不对劲。继母和龙藏寺完()全不记得昨晚发生的事情,此时他才发现原()来父亲寄()给他的遗物是可以让人在平行世界自由穿梭的神奇道具,于是他为了找到父亲()真正的下落展开了一系列调查。